Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms