Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCAPERQ9BY12 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCAPERQ9BY12 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms