Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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NDUFAF3Q9BU61 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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NDUFAF3Q9BU61 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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NDUFAF3Q9BU61 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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NDUFAF3Q9BU61 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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NDUFAF3Q9BU61 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDUFAF3Q9BU61 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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