Protein–RNA interactions for Protein: Q99578

RIT2, GTP-binding protein Rit2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIT2Q99578 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIT2Q99578 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms