Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3R4Q99570 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms