Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NSMCE2Q96MF7 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms