Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C9orf85Q96MD7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms