Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms