Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMNQ96JQ2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms