Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPUSD4Q96CM3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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