Protein–RNA interactions for Protein: Q96BA8

CREB3L1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L1Q96BA8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3L1Q96BA8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms