Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHMTQ93088 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms