Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms