Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF5

ZNRF4, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF4, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF4Q8WWF5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms