Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM35BQ8NCS4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM35BQ8NCS4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms