Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC17Q8N6Y2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms