Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMNTD2Q8IXW0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms