Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms