Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B0

CCDC91, Coiled-coil domain-containing protein 91, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC91Q7Z6B0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC91Q7Z6B0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC91Q7Z6B0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms