Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
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SNX20Q7Z614 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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SNX20Q7Z614 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX20Q7Z614 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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