Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT28Q7Z3Y7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT28Q7Z3Y7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms