Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP43Q70EL4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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