Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LMBR1LQ6UX01 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMBR1LQ6UX01 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms