Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms