Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD4Q5VX71 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUSD4Q5VX71 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms