Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms