Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AGAP6Q5VW22 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AGAP6Q5VW22 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AGAP6Q5VW22 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AGAP6Q5VW22 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AGAP6Q5VW22 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AGAP6Q5VW22 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGAP6Q5VW22 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGAP6Q5VW22 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGAP6Q5VW22 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGAP6Q5VW22 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGAP6Q5VW22 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGAP6Q5VW22 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGAP6Q5VW22 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGAP6Q5VW22 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AGAP6Q5VW22 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms