Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms