Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF20Q5VT98 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms