Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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