Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FGD3Q5JSP0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms