Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms