Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms