Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP28Q4G0W2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms