Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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KRTAP21-3Q3LHN1 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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KRTAP21-3Q3LHN1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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