Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7I2

CNPY1, Protein canopy homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY1Q3B7I2 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
CNPY1Q3B7I2 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPY1Q3B7I2 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPY1Q3B7I2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPY1Q3B7I2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPY1Q3B7I2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPY1Q3B7I2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPY1Q3B7I2 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPY1Q3B7I2 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPY1Q3B7I2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPY1Q3B7I2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPY1Q3B7I2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPY1Q3B7I2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPY1Q3B7I2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPY1Q3B7I2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNPY1Q3B7I2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms