Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms