Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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