Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FSCN1Q16658 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FSCN1Q16658 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FSCN1Q16658 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FSCN1Q16658 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FSCN1Q16658 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FSCN1Q16658 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FSCN1Q16658 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FSCN1Q16658 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FSCN1Q16658 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FSCN1Q16658 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FSCN1Q16658 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FSCN1Q16658 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FSCN1Q16658 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FSCN1Q16658 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FSCN1Q16658 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FSCN1Q16658 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FSCN1Q16658 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
FSCN1Q16658 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FSCN1Q16658 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FSCN1Q16658 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FSCN1Q16658 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FSCN1Q16658 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FSCN1Q16658 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FSCN1Q16658 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FSCN1Q16658 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FSCN1Q16658 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FSCN1Q16658 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
FSCN1Q16658 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
FSCN1Q16658 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FSCN1Q16658 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FSCN1Q16658 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FSCN1Q16658 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FSCN1Q16658 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FSCN1Q16658 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FSCN1Q16658 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FSCN1Q16658 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FSCN1Q16658 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FSCN1Q16658 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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