Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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EXT1Q16394 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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EXT1Q16394 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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EXT1Q16394 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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EXT1Q16394 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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EXT1Q16394 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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EXT1Q16394 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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EXT1Q16394 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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EXT1Q16394 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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EXT1Q16394 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXT1Q16394 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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