Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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