Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTAN1Q13813 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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