Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FHL3Q13643 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms