Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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