Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 TRA2B-214ENST00000487615 4485 ntTSL 1 (best)11.38□□□□□ -0.592e-7■□□□□ 9.9
TARDBPQ13148 SORT1-204ENST00000482236 615 ntTSL 311.28□□□□□ -0.62e-7■□□□□ 9.9
TARDBPQ13148 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.322e-7■□□□□ 9.9
TARDBPQ13148 TRA2B-210ENST00000471134 724 ntTSL 56.43□□□□□ -1.382e-7■□□□□ 9.9
TARDBPQ13148 TAF1-209ENST00000463163 498 ntTSL 35.61□□□□□ -1.512e-7■□□□□ 9.9
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TARDBPQ13148 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.447e-8■□□□□ 9.8
TARDBPQ13148 GABRE-204ENST00000462018 650 ntTSL 38.67□□□□□ -1.022e-9■□□□□ 9.8
TARDBPQ13148 GABRE-209ENST00000486255 6176 ntTSL 1 (best)8.62□□□□□ -1.032e-9■□□□□ 9.8
TARDBPQ13148 AC016723.1-202ENST00000436982 643 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.933e-7■□□□□ 9.7
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TARDBPQ13148 NCKAP1-202ENST00000361354 20347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.081e-6■□□□□ 9.7
TARDBPQ13148 NCKAP1-205ENST00000478449 713 ntTSL 35.21□□□□□ -1.581e-6■□□□□ 9.7
TARDBPQ13148 RABGGTB-209ENST00000473406 721 ntTSL 57.13□□□□□ -1.272e-7■□□□□ 9.7
TARDBPQ13148 RABGGTB-205ENST00000462042 569 ntTSL 37.08□□□□□ -1.282e-7■□□□□ 9.7
TARDBPQ13148 RABGGTB-212ENST00000491266 961 ntTSL 35.89□□□□□ -1.472e-7■□□□□ 9.7
TARDBPQ13148 RABGGTB-207ENST00000470201 848 ntTSL 35.75□□□□□ -1.492e-7■□□□□ 9.7
TARDBPQ13148 RABGGTB-210ENST00000485459 788 ntTSL 55.56□□□□□ -1.522e-7■□□□□ 9.7
TARDBPQ13148 RABGGTB-204ENST00000461653 1702 ntTSL 55.55□□□□□ -1.522e-7■□□□□ 9.7
TARDBPQ13148 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.62e-7■□□□□ 9.7
TARDBPQ13148 RABGGTB-211ENST00000489450 586 ntTSL 54.24□□□□□ -1.732e-7■□□□□ 9.7
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TARDBPQ13148 SLC25A37-210ENST00000522164 571 ntTSL 216.02■□□□□ 0.165e-7■□□□□ 9.7
TARDBPQ13148 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.27■■□□□ 1.163e-7■□□□□ 9.7
TARDBPQ13148 AC093323.1-203ENST00000444232 1605 ntTSL 1 (best)21.85■■□□□ 1.093e-7■□□□□ 9.7
TARDBPQ13148 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.93e-7■□□□□ 9.7
TARDBPQ13148 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.329e-7■□□□□ 9.7
TARDBPQ13148 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.219e-7■□□□□ 9.7
TARDBPQ13148 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.119e-7■□□□□ 9.7
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TARDBPQ13148 ZNF789-203ENST00000447047 842 ntTSL 515.42■□□□□ 0.069e-7■□□□□ 9.7
TARDBPQ13148 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.049e-7■□□□□ 9.7
TARDBPQ13148 ZNF789-210ENST00000488485 1884 ntTSL 214.61□□□□□ -0.079e-7■□□□□ 9.7
TARDBPQ13148 NSD2-218ENST00000508355 2092 ntTSL 1 (best)13.12□□□□□ -0.314e-7■□□□□ 9.7
TARDBPQ13148 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.334e-7■□□□□ 9.7
TARDBPQ13148 NSD2-216ENST00000507820 528 ntTSL 512.9□□□□□ -0.344e-7■□□□□ 9.7
TARDBPQ13148 ZNF789-209ENST00000483089 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.529e-7■□□□□ 9.7
TARDBPQ13148 TXLNA-202ENST00000373610 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.64e-7■□□□□ 9.7
TARDBPQ13148 ZNF789-205ENST00000465438 4253 ntTSL 1 (best)9.19□□□□□ -0.949e-7■□□□□ 9.7
TARDBPQ13148 NSD2-224ENST00000514045 3964 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.174e-7■□□□□ 9.7
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TARDBPQ13148 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.377e-7■□□□□ 9.6
TARDBPQ13148 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.497e-7■□□□□ 9.6
TARDBPQ13148 ATF7IP2-215ENST00000568027 3406 ntTSL 1 (best)5.41□□□□□ -1.547e-7■□□□□ 9.6
TARDBPQ13148 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.667e-7■□□□□ 9.6
TARDBPQ13148 PPP6R3-225ENST00000534190 1980 ntTSL 212.8□□□□□ -0.361e-7■□□□□ 9.6
TARDBPQ13148 PPP6R3-211ENST00000526574 489 ntTSL 58.95□□□□□ -0.981e-7■□□□□ 9.6
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TARDBPQ13148 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.042e-6■□□□□ 9.5
TARDBPQ13148 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.032e-6■□□□□ 9.5
TARDBPQ13148 JRK-202ENST00000506774 561 ntTSL 38.19□□□□□ -1.12e-6■□□□□ 9.5
TARDBPQ13148 SYMPK-208ENST00000598059 611 ntTSL 421.7■■□□□ 1.067e-7■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.724e-9■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 SYMPK-205ENST00000594293 623 ntTSL 418.11■□□□□ 0.497e-7■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 SYMPK-204ENST00000593959 546 ntTSL 416.65■□□□□ 0.267e-7■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 PAX8-AS1-206ENST00000445745 2570 ntTSL 1 (best)14.35□□□□□ -0.114e-9■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.124e-9■□□□□ 9.4
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TARDBPQ13148 PAX8-AS1-207ENST00000451179 1196 ntTSL 1 (best)10.08□□□□□ -0.84e-9■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 PAX8-AS1-215ENST00000616073 512 ntTSL 49.3□□□□□ -0.924e-9■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 AMD1-201ENST00000368876 3040 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.957e-7■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 PAX8-AS1-201ENST00000333145 2319 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.124e-9■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 PAX8-AS1-210ENST00000553869 560 ntTSL 57.38□□□□□ -1.234e-9■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 AMD1-207ENST00000612642 4745 ntTSL 1 (best)7.06□□□□□ -1.287e-7■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 WEE1-203ENST00000524549 5187 ntTSL 26.94□□□□□ -1.34e-9■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.347e-7■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 AMD1-205ENST00000451850 3121 ntTSL 1 (best)6.32□□□□□ -1.47e-7■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.457e-7■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 AMD1-208ENST00000619590 4329 ntTSL 25.95□□□□□ -1.467e-7■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 PAX8-AS1-212ENST00000556070 567 ntTSL 45.82□□□□□ -1.484e-9■□□□□ 9.4
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TARDBPQ13148 WEE1-204ENST00000524612 573 ntTSL 44.96□□□□□ -1.624e-9■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 PPP6R3-213ENST00000527069 573 ntTSL 54.06□□□□□ -1.767e-7■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 PAX8-AS1-220ENST00000624706 434 ntTSL 53.68□□□□□ -1.824e-9■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 ZNF330-204ENST00000507532 836 ntTSL 311.1□□□□□ -0.632e-6■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 ZNF330-206ENST00000512809 838 ntTSL 310.59□□□□□ -0.712e-6■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 ZNF330-205ENST00000512738 552 ntTSL 410.11□□□□□ -0.792e-6■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 ZNF330-202ENST00000503649 573 ntTSL 54.61□□□□□ -1.672e-6■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 MAP2K7-205ENST00000468058 1589 ntTSL 224.45■■□□□ 1.55e-8■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.115e-8■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.15e-8■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.225e-8■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 UBE2J2-207ENST00000435198 1056 ntTSL 326.78■■□□□ 1.882e-6■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 UBE2J2-210ENST00000464036 1256 ntTSL 323.28■■□□□ 1.322e-6■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.292e-6■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 UBE2J2-206ENST00000422076 643 ntTSL 521.64■■□□□ 1.052e-6■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 UBE2J2-219ENST00000503294 814 ntTSL 421.64■■□□□ 1.052e-6■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.972e-6■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 UBE2J2-209ENST00000461142 837 ntTSL 321.13■□□□□ 0.972e-6■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 UBE2J2-214ENST00000473215 1028 ntTSL 321■□□□□ 0.952e-6■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 UBE2J2-208ENST00000450390 2455 ntTSL 520.63■□□□□ 0.892e-6■□□□□ 9.4
TARDBPQ13148 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.782e-6■□□□□ 9.4
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