Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms