Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

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Length 2,346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACACAQ13085 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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