Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRDM2Q13029 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRDM2Q13029 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
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