Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB40BQ12829 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms