Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TROQ12816 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TROQ12816 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TROQ12816 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TROQ12816 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TROQ12816 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TROQ12816 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TROQ12816 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TROQ12816 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TROQ12816 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TROQ12816 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TROQ12816 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TROQ12816 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TROQ12816 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TROQ12816 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TROQ12816 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TROQ12816 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TROQ12816 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TROQ12816 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TROQ12816 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TROQ12816 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TROQ12816 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TROQ12816 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TROQ12816 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TROQ12816 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TROQ12816 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TROQ12816 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TROQ12816 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TROQ12816 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TROQ12816 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TROQ12816 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TROQ12816 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TROQ12816 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TROQ12816 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TROQ12816 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TROQ12816 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TROQ12816 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TROQ12816 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TROQ12816 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TROQ12816 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TROQ12816 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TROQ12816 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TROQ12816 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TROQ12816 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TROQ12816 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TROQ12816 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TROQ12816 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TROQ12816 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TROQ12816 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TROQ12816 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TROQ12816 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TROQ12816 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TROQ12816 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TROQ12816 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TROQ12816 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TROQ12816 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TROQ12816 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TROQ12816 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TROQ12816 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms